鼻镜检查通常不会造成剧烈疼痛，但可能引起短暂不适或轻微胀痛感。检查前会使用表面麻醉剂减轻敏感度，多数患者可耐受该操作。
鼻镜检查的不适感主要来源于器械接触鼻腔黏膜时的异物感。医生会将直径约3-4毫米的软性内窥镜经前鼻孔缓慢插入，过程中可能触发打喷嚏反射或流泪反应。麻醉凝胶能有效降低鼻腔敏感度，但部分人群仍会感受到镜体移动时的牵拉感，这种胀痛类似游泳呛水后的鼻腔酸胀，持续时间通常不超过10分钟。儿童或鼻腔结构异常者可能出现较强不适，此时医生会调整进镜角度或暂停操作。
极少数情况下，鼻腔严重狭窄、鼻中隔偏曲或黏膜高度水肿的患者可能经历较明显疼痛。这类人群往往伴有慢性鼻炎或鼻息肉病史，狭窄的鼻道会增加器械通过的阻力。急性鼻窦炎发作期检查也可能加重胀痛，因脓性分泌物会阻碍镜体前进路径。若检查中发现肿瘤等占位性病变，活检取样时可能出现短暂刺痛，但会追加局部麻醉。
检查后2小时内避免用力擤鼻，防止麻醉状态下黏膜损伤出血。可少量饮用温水缓解咽喉部麻木感，当日饮食宜选择温凉流质食物。鼻腔干燥者可用生理盐水喷雾湿润黏膜，但禁止自行使用血管收缩剂。如出现持续出血、剧烈头痛或视力变化需立即返院。定期鼻镜检查对早期发现鼻腔病变具有重要意义，建议有鼻塞、涕血等症状者每1-2年检查一次，吸烟人群或长期接触粉尘者应缩短至每年一次。