种植头发过程中会有轻微疼痛感，但通常可以耐受。手术前会进行局部麻醉，术中疼痛感不明显，术后可能出现短暂胀痛或不适。
毛发移植手术采用局部麻醉技术，在头皮注射麻醉药物时会有短暂刺痛感，类似打针的痛感。麻醉生效后，提取毛囊和种植过程中基本无痛觉。手术时间根据移植数量不同，通常需要2-6小时，期间患者保持清醒但不会感到疼痛。术后麻醉消退后，供区取发部位和种植区域可能出现轻微胀痛，这种不适感多数在24-48小时内逐渐缓解。医生会根据情况开具止痛药物帮助缓解症状。
极少数对疼痛特别敏感的人群，或术中麻醉效果不理想时，可能会有较强痛感。这类情况医生会及时调整麻醉方案。术后若出现持续剧烈疼痛、红肿发热等异常症状，可能提示感染等并发症，需要立即就医处理。有凝血功能障碍、慢性疼痛疾病或麻醉药物过敏史的患者，术前需主动告知医生。
术后建议保持头部抬高姿势睡眠，避免触碰移植区域，48小时内避免洗头。饮食宜清淡，避免辛辣刺激食物和酒精。按医嘱服用抗生素预防感染，使用生理盐水喷雾保持头皮湿润。术后1周内避免剧烈运动，2周内不要游泳或蒸桑拿。种植的毛发会在2-3周后进入脱落期，这是正常现象，3-6个月后新发会逐渐生长。定期复诊有助于医生评估毛囊成活情况，发现问题可及时干预。