颅内结核感染的严重程度与病情进展阶段有关，早期规范治疗多数可控制，延误治疗可能导致不可逆神经损伤。
结核分枝杆菌侵犯中枢神经系统后，早期主要表现为低热、头痛、食欲减退等非特异性症状，此时通过规范的抗结核治疗如异烟肼片、利福平胶囊、吡嗪酰胺片等药物联合使用，配合糖皮质激素减轻炎症反应，多数患者预后良好。若未及时干预，随着肉芽肿形成和脑膜粘连加重，可能出现脑积水、颅神经麻痹、癫痫发作等并发症，部分患者遗留视力障碍、肢体瘫痪等后遗症。重症患者因颅内压急剧升高或脑疝形成，可能危及生命。
确诊颅内结核感染后需严格遵医嘱完成6-9个月抗结核疗程，治疗期间定期复查脑脊液和影像学评估疗效，注意补充优质蛋白和维生素增强免疫力，避免剧烈运动或情绪激动诱发颅内压波动，出现呕吐、意识改变等紧急症状时须立即就医。康复阶段可进行认知训练和肢体功能锻炼，结核活动期需隔离防止传播，密切接触者应进行结核菌素试验筛查。