扁桃体炎手术存在一定风险，但多数情况下可控。手术风险与患者个体差异、手术方式及术后护理等因素相关。
扁桃体炎手术常见风险包括术中出血、术后感染及麻醉相关并发症。术中出血多因扁桃体周围血管丰富，若止血不彻底可能导致出血量增加，需及时处理。术后感染通常表现为发热、咽痛加重，与口腔细菌定植有关，可通过抗生素预防。麻醉风险多见于儿童或合并基础疾病者，如呼吸抑制、药物过敏等，术前评估可降低发生概率。
少数情况下可能出现术后咽部瘢痕形成导致吞咽困难，或长期味觉异常。瘢痕形成与个体愈合能力相关，需通过康复训练改善。味觉异常多因手术损伤舌咽神经分支，通常数月内自行恢复。罕见并发症如颈深部感染或术后出血需二次手术，发生率极低但需警惕。
术后应保持口腔清洁，使用生理盐水漱口每日3-4次，避免剧烈咳嗽或用力擤鼻。饮食以温凉流质为主，逐步过渡至软食，禁止摄入辛辣、坚硬食物。术后1周内避免剧烈运动，观察有无出血或持续发热，若出现颈部肿胀、呕血等症状需立即就医。儿童患者家长需监督其避免用手触碰创面，定期复查至黏膜完全修复。