智齿仅剩牙根时拔除难度通常较大，但多数情况下仍可通过专业手术完成。残留牙根可能因位置深、骨质包裹或邻近神经血管增加操作风险，需由口腔外科医生评估后制定个性化方案。
当智齿牙冠完全龋坏仅剩牙根时，拔除过程需先通过影像学检查明确牙根形态与周围解剖结构的关系。若牙根较短且未弯曲，周围骨阻力较小，可采用常规挺子或微创拔牙器械直接取出。术中可能需少量去骨以暴露牙根，但整体创伤可控，术后恢复与普通拔牙相似。
若残留牙根较长、弯曲或紧贴下颌神经管，则需采用超声骨刀或高速涡轮手机分根，避免强行撬动导致骨板骨折或神经损伤。部分病例需翻瓣去骨充分暴露术野，术后可能出现短暂性下唇麻木，但多数在3-6个月内恢复。极少数低位水平阻生伴牙根吸收的病例，可能需转诊至颌面外科进行全麻下手术。
术后24小时内应避免漱口或吮吸创口，进食温凉软食以减少出血风险。48小时后可开始用生理盐水轻柔含漱，保持口腔清洁但避免触碰血凝块。若出现持续剧痛、肿胀加重或发热超过38.5℃，需及时复诊排除干槽症或感染。建议术前完善锥形束CT检查精准评估风险，选择有复杂牙拔除经验的医生操作，术后遵医嘱使用氯己定含漱液预防感染，并定期复查愈合情况。