蛀牙只剩牙根时通常需要拔除，拔牙过程需由口腔外科医生评估后实施，主要方式有常规拔牙术、微创拔牙术等。
当蛀牙仅剩牙根时，牙冠已完全破坏，牙根可能伴有感染或残留在牙槽骨内。医生会先通过口腔检查结合X光片评估牙根位置、形态及周围骨质情况。若牙根完整且位置较浅，可采用常规拔牙术，使用牙挺和牙钳逐步松动并取出牙根。若牙根断裂、弯曲或深埋于骨内，需采用微创拔牙术，通过超声骨刀或高速涡轮手机分割牙根后分块取出，减少对周围组织的损伤。拔牙后需压迫止血，必要时缝合创口，术后24小时内避免漱口或进食过热食物。
拔除残留牙根后，建议1-2周内避免用患侧咀嚼，保持口腔清洁，使用生理盐水轻柔漱口。若计划后续修复缺牙，可在拔牙后3个月评估牙槽骨条件，选择种植牙、固定桥或活动义齿等方案。日常需加强口腔卫生，使用含氟牙膏刷牙，定期洁牙及口腔检查，预防邻牙龋坏或牙周病。