甲状腺功能减退症可能存在误诊情况，但通过规范的实验室检查和临床表现评估可显著降低误诊概率。诊断需结合促甲状腺激素、游离甲状腺素等指标及症状综合判断。
甲状腺功能减退症的诊断主要依赖血清学检测。促甲状腺激素升高伴游离甲状腺素降低是典型表现，但亚临床甲减仅表现为促甲状腺激素升高。部分患者可能出现甲状腺抗体阳性，提示自身免疫性甲状腺炎可能。实验室误差、急性疾病状态、药物干扰等因素可能导致结果异常，需重复检测确认。妊娠期女性因激素变化可能出现促甲状腺激素水平波动，需采用妊娠特异性参考范围。
少数情况下，中枢性甲减表现为促甲状腺激素正常或偏低伴游离甲状腺素降低，易被漏诊。某些非甲状腺疾病如严重营养不良、垂体病变可能导致类似甲减的实验室改变。检测前未空腹或近期使用生物素补充剂可能干扰检测结果准确性。存在甲状腺激素抵抗综合征时，尽管实验室指标异常但患者可能无明显症状。
确诊甲状腺功能减退症后应定期监测甲状腺功能，根据检查结果调整药物剂量。日常需保证均衡饮食，适量摄入含碘食物如海带、紫菜，但避免过量。注意保暖，适度运动改善代谢，保证充足睡眠。出现乏力加重、体重异常变化等症状时应及时复诊，避免自行调整药物。合并心血管疾病者需密切监测心率血压变化，备孕及妊娠期女性需特别关注甲状腺功能状态。