婴儿扁桃体发炎可能自愈，但需结合病情严重程度判断。轻度扁桃体发炎可能自愈，严重时需及时就医。
婴儿免疫系统尚未发育完善，扁桃体作为免疫器官容易受到病毒或细菌感染。若由普通病毒感染引起，症状较轻时可能出现咽痛、低热，通常1周内可自行缓解。此时保持充足水分摄入、适当休息有助于恢复。
当扁桃体发炎由细菌感染引起或伴随持续高热、吞咽困难、颈部淋巴结肿大时，自愈概率较低。链球菌感染可能引发风湿热、肾炎等并发症，需抗生素治疗。反复发作的化脓性扁桃体炎可能影响呼吸和进食，需考虑医疗干预。
家长应密切观察婴儿症状变化，保持室内空气流通，使用加湿器缓解咽部干燥。哺乳期母亲需注意饮食清淡，避免辛辣刺激食物。若发现婴儿拒食、精神萎靡或发热超过3天，应立即就医。未经医生指导不要擅自使用退热药或抗生素，2岁以下婴儿禁用含苯海拉明的感冒药。日常可通过清洁鼻腔、适当抬高床头等方式减少呼吸道刺激。