根管治疗后可能会得根尖周炎，但概率较低。根尖周炎通常与根管治疗不彻底、细菌感染或牙体修复不当等因素有关。
根管治疗是清除牙髓腔内感染组织并封闭根管的过程，多数情况下能有效预防根尖周炎。治疗成功的关键在于彻底清除坏死牙髓、严密填充根管以及后期牙冠修复的密封性。若根管预备不充分、残留感染物质或充填不密合，细菌可能通过根尖孔扩散至周围组织，引发炎症反应。临床表现为患牙咬合痛、牙龈肿胀甚至瘘管形成。
少数情况下，即使规范操作仍可能出现根尖周炎，原因包括根管解剖变异如侧支根管未被清理、患者免疫力低下或术后护理不当。长期存在的慢性根尖周炎可能导致骨质破坏，需通过根管再治疗或根尖手术干预。
根管治疗后应避免用患牙咀嚼硬物，保持口腔卫生以减少细菌滋生。定期复查X线片监测根尖周组织状态，若出现持续疼痛或肿胀需及时就诊。选择经验丰富的牙医进行操作，并使用橡皮障隔离等技术可显著降低感染风险。日常可使用含氯己定的漱口水辅助控制菌斑，但无须过度依赖抗生素预防感染。