沙棘醋每天建议饮用10-30毫升，可分1-2次服用。沙棘醋含有有机酸及活性成分，过量可能刺激胃肠黏膜，需根据个体耐受性调整。
沙棘醋的每日摄入量需结合浓度与用途综合考量。未经稀释的原液每日摄入量不宜超过10毫升，可加入温水或蜂蜜调和后饮用。用于辅助调节血脂或抗氧化时，建议每日15-20毫升分两次服用，餐后饮用可减少胃部不适。若作为调味品添加于菜肴中，单日总量宜控制在30毫升内。胃肠功能较弱者应从5毫升开始逐步增加，出现反酸或腹胀需减量。饮用后建议用清水漱口以避免酸性物质腐蚀牙釉质。沙棘醋与部分药物可能存在相互作用，服用抗凝药物或胃酸抑制剂者应咨询医师。
日常饮用沙棘醋需避免空腹状态，可搭配全麦面包或燕麦等碱性食物缓冲酸性刺激。长期饮用者应定期检查胃黏膜状况，孕妇及胃溃疡患者慎用。建议选择玻璃瓶装产品避免塑化剂迁移，开封后需冷藏并在一个月内用完。若出现腹泻或皮肤过敏需立即终止饮用并就医。