还没熟的番茄通常不建议食用。未成熟的番茄含有较多龙葵碱，可能引起胃肠不适甚至中毒，成熟后龙葵碱含量会显著降低。
未成熟的番茄表皮呈青绿色，果肉较硬且酸涩，其中龙葵碱含量较高。这种生物碱对胃肠黏膜有刺激作用，摄入后可能出现恶心、呕吐、腹痛等中毒症状。部分人群食用后还会出现口腔麻木或烧灼感。传统烹饪方法如高温加热只能破坏少量龙葵碱，无法完全消除其毒性。将未成熟番茄与乙烯释放型水果如苹果、香蕉共同存放，可加速其成熟过程。
完全成熟的番茄表皮呈现均匀红色或黄色，触感稍软且散发清香，此时龙葵碱含量已降至安全范围。成熟番茄富含番茄红素、维生素C和钾等营养素，其中番茄红素需经油脂烹调更易被人体吸收。特殊情况下少量使用未成熟番茄制作腌制食品时，需确保经过充分发酵或醋渍处理以降低风险。
建议选择自然成熟的番茄食用，若误食未成熟番茄后出现不适症状应及时就医。储存番茄时应避免阳光直射，室温通风环境下可促进后熟。有慢性胃肠疾病或过敏体质者更需谨慎食用未完全成熟的番茄。