拔下面的智齿通常比上面疼，主要与下颌骨结构致密、神经分布密集、手术操作难度大等因素有关。
下颌智齿位于下颌骨内，骨质较上颌更坚硬致密，拔除时需更大力度切割或磨除骨质，创伤面更大。下颌骨内有下牙槽神经穿过，智齿根尖常紧邻或包裹该神经，术中牵拉可能刺激神经引发剧烈疼痛。下颌智齿多呈水平或倾斜生长，需切开牙龈、去骨、分牙等复杂操作，手术时间延长也会加重术后肿胀疼痛。上颌骨骨质较疏松，智齿根尖距离上颌窦较近但神经分布较少，拔除阻力小且操作简单，术后反应相对较轻。
少数情况下，上颌智齿若紧贴上颌窦或与邻牙牙根粘连，拔除时可能导致上颌窦穿孔或邻牙损伤，此时疼痛程度可能与下颌智齿相当。但这类情况发生概率较低，多数患者仍表现为下颌智齿拔除后疼痛更明显。
术后48小时内可冰敷减轻肿胀，避免剧烈漱口或吮吸伤口。选择经验丰富的口腔外科医生操作能降低术中创伤风险，若出现持续剧痛、张口困难或发热，需及时复诊排除干槽症或感染。饮食以温凉流质为主，避免辛辣刺激食物，遵医嘱服用镇痛药物。