栀子干姜泡水喝可能出现胃肠不适、上火等副作用，特殊人群需谨慎使用。
栀子性寒，干姜性温，两者配伍可能刺激胃肠黏膜，空腹饮用时易引发胃痛、腹泻等症状。长期过量服用可能加重肝肾代谢负担，尤其肝功能异常者可能出现转氨酶升高。阴虚火旺体质人群饮用后可能诱发口干舌燥、咽喉肿痛等上火反应，妊娠期女性不当使用可能影响胎儿发育。
栀子所含京尼平苷可能引起轻度中枢抑制，与镇静类药物同服可能增强嗜睡效应。干姜的姜酚成分对凝血功能存在潜在影响，围手术期患者或抗凝治疗者需避免使用。两种药材均可能引起过敏反应，表现为皮肤瘙痒、皮疹等，过敏体质者初次饮用应减量测试。
建议在中医师指导下辨证使用，连续饮用不宜超过7天。出现恶心呕吐、心悸等不良反应应立即停用。饮用期间忌食辛辣油腻，避免与寒凉或温补类中药同时服用。储存时需防潮防蛀，霉变药材禁止泡服。儿童、老年人及慢性病患者使用前应咨询专业医师，根据体质调整配伍比例。