甜菜碱的副作用和危害通常较少，但过量摄入可能引起胃肠不适、低血压或代谢异常。甜菜碱常用于改善心血管健康或作为运动补剂，其安全性取决于摄入剂量和个体差异。
甜菜碱过量可能导致恶心、腹泻或腹部不适，这与高剂量刺激胃肠黏膜有关。部分人群可能出现头晕或乏力，尤其与降压药物联用时可能增强降压效果。长期超量使用可能干扰体内同型半胱氨酸代谢平衡，影响肝肾代谢功能。对甜菜碱过敏者可能出现皮肤瘙痒或皮疹等过敏反应。特殊人群如孕妇或肝肾功能不全者需谨慎使用，可能加重代谢负担。
日常饮食中甜菜碱天然食物来源如甜菜、菠菜等安全性较高，但浓缩补剂需控制剂量。使用前应评估自身慢性病及用药情况，避免与降压药或利尿剂同时服用。出现持续不适需及时停用并就医，定期监测血压和肝肾功能可降低风险。建议通过均衡饮食获取营养素，补剂使用需在医生或营养师指导下进行。