一般情况下，没有“诊断小肝癌的最佳方法”这一准确说法，但患者可以通过定性诊断、甲胎蛋白检查、超声检查等方式对小肝癌有进一步判断，具体分析如下：

进行乙肝病毒或丙肝病毒的检查时，若该项目呈阳性，则应该考虑是否有小肝癌。甲胎蛋白的检查，如果出现持续一个月以上的>500ng/ml，并排除其他的疾病时，则可能是出现了亚临床肝癌。当甲胎蛋白的检查中出现20ng/ml时，则应采取以下检查加以辅助超声和肿瘤标记。如果超声检查有1.5-2cm以上的肿瘤，或腹腔或肝的动脉造影，可辨别出1-2cm甚至是0.5cm的肿瘤时，可帮助诊断小肝癌。

其他还有CT、核磁共振等，可以帮助诊断小肝癌。多数的小肝癌无明显的临床症状和体征，常在健康体检或乙肝病人定期随访时发现。其手术切除率和术后5年生存率明显高于直径>3cm的肝癌病人。但仍有约百分之10的小肝癌出现异倍体DNA含量，并表现为浸润性生长，突破包膜，形成微型结节与瘤栓等与大肝癌相同的恶性生物学行为。