柠檬具有一定的杀菌作用，主要与柠檬酸、维生素C、挥发性成分和抗氧化物质有关。
1、柠檬酸：
柠檬酸能破坏细菌细胞膜结构，对部分口腔和消化道细菌有抑制作用，可辅助预防龋齿和胃肠感染。
2、维生素C：
维生素C通过增强白细胞活性间接提升杀菌能力，有助于缩短呼吸道感染病程。
3、挥发性成分：
柠檬皮中的柠檬烯等成分对空气中部分病原微生物有抑制作用，可辅助净化环境。
4、抗氧化物质：
类黄酮等成分通过清除自由基抑制细菌繁殖，对皮肤表面常见菌群有一定效果。
日常可用柠檬水漱口或清洁物品表面，但严重感染仍需规范使用抗菌药物，避免依赖食物杀菌。