精神分裂症的病因尚末完全阐明，较公认的观点是：易感素质和外部不良因素通过内在生物学因素共同作用而导致疾病的发生。中枢5-羟色胺水平异常，新型抗精神病药除了对多巴胺受体有拮抗作用外，还对5-羟色胺受体有拮抗作用。中枢谷氨酸水平低下，功能不足。神经解剖和神经影像学研究显示，精神分裂症患者颞叶、额叶及边缘系统存在脑组织萎缩，脑室扩大和沟回增宽。母孕期病毒感染、围产期并发症、幼年的不良应激和躯体疾病与神经系统发育缺陷有关，在精神分裂症发病中有一定影响。遗传因素流行病学调查显示，精神分裂症患者亲属中的患病率高于一般人群，血缘关系越近，患病率越高。