约经7天潜伏期后,逐渐出现结膜充血,眼睑水肿,畏光和流泪,常为双侧性.上睑睑结膜在7~10天后出现小滤泡,3~4周内小滤泡逐渐增大和增多.此期开始上睑睑结膜出现炎性乳头和角膜新生血管形成,血管袢从角膜缘侵入角膜上半部.滤泡/乳头肥大和角膜新生血管形成可持续数月至1年以上,这取决于对治疗的反应.最终可累及整个角膜,于是视力减退.有时未经治疗角膜新生血管可完全消退,角膜恢复透明,但属罕见.
除非经适当治疗,否则进入瘢痕(瘢痕形成)期.滤泡和乳头逐渐收缩为瘢痕组织所取代,而常引起睑内翻和泪道阻塞.睑内翻进一步的引起角膜瘢痕形成和新生血管形成.常继发细菌性感染,导致瘢痕形成和疾病的迁延.角膜上皮变混浊并增厚,泪液减少.周边角膜浸润处可出现小的角膜溃疡,进一步刺激角膜新生血管形成.痊愈后的结膜光滑呈灰白色,残留角膜混浊的范围和视力减退的程度各异.