低位肛瘘切开术通常会有轻微疼痛，术后疼痛程度主要与麻醉效果、个体耐受力、创面大小、术后护理等因素有关。
1、麻醉效果
术中采用局部麻醉或骶管麻醉可有效阻断痛觉传导，麻醉失效后可能出现短暂隐痛。
2、个体耐受力
疼痛敏感人群术后可能出现较明显胀痛，一般72小时内逐渐缓解。
3、创面大小
瘘管分支少且位置浅表者疼痛较轻，复杂肛瘘需扩大切口可能加重不适感。
4、术后护理
按时换药、保持肛门清洁可减少感染概率，坐浴能缓解括约肌痉挛性疼痛。
术后建议选择高膳食纤维饮食，避免久坐压迫伤口，若出现持续剧痛或发热需及时复诊。