百合固金丸可能出现口干、轻微头晕、胃肠不适、过敏反应等副作用，通常症状较轻且可自行缓解。
1、口干
部分患者服药后可能出现暂时性口干，与方中滋阴成分相关，建议适量增加饮水。
2、头晕
偶见轻微头晕现象，多因药物起效后气血运行调整所致，平卧休息后可缓解。
3、胃肠不适
少数敏感体质可能出现腹胀或食欲减退，建议饭后服用以减轻刺激。
4、过敏反应
极个别患者对药物成分过敏，表现为皮疹或瘙痒，需立即停药并就医。
用药期间出现持续不适应及时咨询医师，避免与寒凉食物同服，过敏体质者用药前应告知医生既往过敏史。