肛瘘手术体位通常由医生根据手术方式决定，常见体位有截石位、侧卧位或俯卧位，俯卧位仅为部分术式选择。
1、截石位
适用于低位肛瘘切除术，患者仰卧双腿屈曲抬高固定于支架，便于术野暴露。
2、侧卧位
适用于单纯性肛瘘手术，患者侧卧屈膝，利于麻醉管理且减少体位相关并发症。
3、俯卧位
复杂性肛瘘或需后路手术时采用，患者俯卧垫高骨盆，但需注意胸部受压风险。
4、体位选择
最终体位由瘘管走向、深度及术式决定，术前麻醉师会评估患者心肺耐受情况。
术后早期建议采用侧卧位减轻伤口压迫，保持肛周清洁干燥，避免久坐久站促进愈合。