遗传代谢病检查费用一般在500元到5000元，实际费用受到检查项目数量、检测技术类型、医院级别、地区差异等多种因素的影响。
1、检查项目数量
基础筛查如血尿常规费用较低，若需基因测序或质谱分析等特殊检测，费用会显著增加。
2、检测技术类型
传统生化检测费用约数百元，高通量测序或串联质谱等技术单价可能超过3000元。
3、医院级别
三甲医院因设备精度和专家资源，费用通常比基层医院高30％-50％。
4、地区差异
一线城市检测成本高于二三线城市，部分地区医保可报销部分新生儿筛查费用。
建议提前咨询医院检验科了解具体项目定价，部分遗传代谢病筛查可享受公共卫生项目补贴。