消灭灰指甲菌可以通过外用药物、口服药物和家庭护理等方式。外用药物如阿莫罗芬搽剂、环吡酮搽剂和盐酸特比萘芬乳膏等可直接作用于病甲，需坚持足疗程、规律用药。口服药物如特比萘芬、伊曲康唑和氟康唑等需在医生指导下使用，以减少肝肾功能损害。家庭护理方面，患者应与家人分开使用个人用品，避免搔抓并消毒病甲周围物品，预防传染和继发感染。预防措施包括保持足部干燥清洁、不穿不透气鞋袜、不与他人共用生活用品，以及养成良好的卫生习惯和正确修剪指甲。甲癣患者治疗期间应注意休息、加强营养，避免辛辣刺激食物，如出现不适应及时就医。