漱口水使用前应先刷牙，使用时含漱30秒后吐出，无须再用清水漱口。
漱口水应在刷牙后使用，刷牙能清除牙齿表面大部分食物残渣和牙菌斑，此时使用漱口水能更有效发挥作用。使用漱口水时取10-20毫升倒入量杯，含入口腔后紧闭嘴唇，让液体充分接触牙齿和牙龈，通过鼓腮动作使液体在口腔内流动，持续30秒后吐出。含漱时间不足会影响杀菌效果，过长可能导致口腔黏膜刺激。含漱后无须再用清水漱口，避免冲走残留的有效成分。含酒精的漱口水可能引起短暂灼烧感，儿童、孕妇及酒精过敏者应选择无酒精配方。
日常使用漱口水建议每天1-2次，长期使用含抗菌成分的漱口水需咨询牙医。