超声肠镜检查多数情况下仅有轻微不适感，疼痛程度主要与受检者耐受性、肠道准备情况、操作技术及病变性质有关。
1、耐受性差异个体对疼痛的敏感度不同，部分人群可能因紧张或低痛阈感觉明显不适，检查前可通过深呼吸放松缓解。
2、肠道准备未严格遵医嘱清肠会导致肠腔残留物干扰，可能增加操作难度和牵拉感，完善准备可降低不适概率。
3、操作因素医师手法轻柔程度和探头通过肠管弯曲部位时的力度可能影响体验，选择经验丰富的医师有助于减轻不适。
4、病变影响存在肠粘连、溃疡或肿瘤等病变时，检查中触碰病灶可能引发短暂锐痛，需及时告知医师调整操作。
检查后建议两小时内避免进食，可饮用温水并观察有无持续腹痛，24小时内禁止剧烈运动。
