阿莫西林副作用通常较轻微，多数患者可耐受。常见不良反应主要有胃肠道不适、过敏反应、肝功能异常、二重感染。
阿莫西林可能引起恶心呕吐或腹泻，与药物刺激胃肠黏膜有关。症状较轻时可饭后服药，严重者需换用其他抗生素。
部分患者可能出现皮疹或皮肤瘙痒等过敏症状，严重时可发生过敏性休克。用药前需确认青霉素过敏史，出现荨麻疹应立即停药。
长期大剂量使用可能导致转氨酶升高，通常停药后可恢复。用药期间建议定期监测肝功能指标。
广谱抗菌作用可能破坏正常菌群平衡，诱发口腔或阴道真菌感染。可配合益生菌制剂预防，出现鹅口疮需抗真菌治疗。
用药期间出现严重腹泻或呼吸困难等不良反应应及时就医，避免与丙磺舒等药物联用，肝功能不全者需调整剂量。
