真菌性肠炎属于机会性感染疾病，治疗难度与患者免疫状态、菌种耐药性、基础疾病控制等因素相关，常见致病菌为白色念珠菌，临床需规范抗真菌治疗结合肠道微生态调节。
1、免疫抑制状态长期使用免疫抑制剂或HIV感染者易迁延不愈，需在抗真菌治疗同时调整基础用药方案，常用药物有氟康唑、伊曲康唑、两性霉素B等。
2、菌株耐药问题反复使用广谱抗生素可能导致耐药念珠菌感染，需进行药敏试验选择敏感药物，严重时可考虑棘白菌素类新型抗真菌药。
3、肠道菌群失衡联合布拉氏酵母菌等益生菌制剂有助于恢复微生态平衡，治疗期间应避免高糖饮食减少真菌繁殖环境。
4、基础疾病影响糖尿病血糖控制不佳或恶性肿瘤患者治疗效果较差，需同步治疗原发病，重症可考虑两性霉素B静脉给药。
治疗期间建议低渣饮食，监测肝肾功能，疗程通常需持续至症状消失后1-2周，免疫功能低下者需延长维持治疗。
