多数情况下肛周脓肿需要手术治疗，保守治疗仅适用于早期浅表脓肿或全身情况无法耐受手术者。
浅表小型脓肿未形成明显脓腔时，可尝试抗生素治疗如头孢克肟、甲硝唑、左氧氟沙星，配合高锰酸钾坐浴。
深部脓肿或伴发热等全身症状必须手术，拖延可能导致败血症或肛瘘，常用术式为脓肿切开引流术或根治性肛瘘手术。
保守治疗复发率较高，脓肿可能扩散至直肠周围间隙，引发坏死性筋膜炎等严重并发症。
术后需保持创面清洁，使用复方角菜酸酯栓促进愈合，定期换药直至脓腔完全闭合。
出现肛周红肿热痛应及时就诊，术后避免久坐久站，饮食注意补充膳食纤维预防便秘。
