黄连上清丸可以辅助治疗口腔溃疡。口腔溃疡的治疗药物主要有西地碘含片、冰硼散、重组人表皮生长因子凝胶等，黄连上清丸适用于由实热内盛引起的溃疡。
黄连上清丸含黄连、黄芩等成分，具有清热泻火功效，对心胃火盛型溃疡可能缓解疼痛，但无法促进创面愈合。
适用于舌红苔黄、伴有口臭便秘的实热证溃疡，对复发性阿弗他溃疡或创伤性溃疡效果有限。
建议配合局部用药如口腔溃疡贴膜，严重者需联合使用免疫调节剂如转移因子口服溶液。
脾胃虚寒者禁用，用药期间忌辛辣油腻，若溃疡超过两周未愈需排查白塞病等系统性疾病。
保持口腔清洁，适量补充维生素B族，避免过硬过热食物刺激溃疡面，反复发作需进行免疫功能检测。
