麝香可能导致不孕，但概率较低。麝香对生殖功能的影响主要与长期高剂量接触、个体敏感性、内分泌干扰作用以及基础生殖系统健康状况有关。
职业性长期接触天然麝香可能干扰下丘脑-垂体-性腺轴，建议从事相关行业者做好防护措施，必要时进行生殖功能评估。
部分人群对麝香中麝香酮等成分代谢能力较弱，可能引起暂时性紊乱，表现为月经周期改变，停药或脱离接触后多可恢复。
麝香酮结构与类固醇激素相似，可能竞争性结合雌激素受体，临床可见排卵障碍病例，需通过激素检测确认关联性。
合并多囊卵巢综合征等疾病时，麝香可能加重内分泌紊乱，此类患者应避免使用含麝香制品，建议优先治疗原发病。
备孕人群应限制麝香暴露，出现月经异常建议检测性激素六项，临床常用药物包括枸橼酸氯米芬、来曲唑等促排卵药物，须在生殖科医师指导下使用。
