长期过量饮用豆浆可能引起胃肠不适、营养失衡等问题，但适量饮用通常无害。
豆浆含有丰富的植物蛋白和膳食纤维，适量饮用有助于补充营养。但长期过量饮用可能影响铁元素吸收，因为豆浆中的植酸会与铁结合形成不溶性盐。部分人群可能出现腹胀或腹泻症状，这与豆浆中的低聚糖不易被消化有关。甲状腺功能异常者需谨慎，大豆异黄酮可能干扰甲状腺激素合成。婴幼儿不宜长期单一饮用豆浆，可能导致蛋白质摄入不足。
建议每日豆浆饮用量控制在200-400毫升，避免空腹饮用。搭配富含维生素C的食物可促进铁吸收。胃肠敏感者可选择经过充分煮沸的豆浆减少不适。生长发育期儿童及孕妇应保证动物蛋白摄入，不宜完全依赖豆浆。存在甲状腺问题或激素相关疾病的人群饮用前应咨询医生意见。
