病毒性角膜炎角膜移植通常可以控制病情，但无法完全除根。病毒性角膜炎的治疗方法主要有抗病毒药物、角膜移植、免疫调节治疗、局部护理等。
阿昔洛韦、更昔洛韦、伐昔洛韦等抗病毒药物可抑制病毒复制，减轻炎症反应，需长期规律使用以预防复发。
对于角膜瘢痕或穿孔患者，穿透性角膜移植或板层角膜移植可恢复视力，但移植后仍需持续抗病毒治疗防止病毒再激活。
糖皮质激素滴眼液需谨慎联用抗病毒药物，适用于严重免疫反应者；环孢素A滴眼液可用于抑制角膜新生血管。
人工泪液缓解干眼症状，角膜修复凝胶促进上皮愈合，严格避免揉眼及佩戴隐形眼镜等刺激因素。
术后需定期复查病毒载量，避免疲劳和强光刺激，出现眼红眼痛需立即就诊。
