牙周治疗多数情况下不会非常痛苦。治疗过程中的不适感主要与炎症程度、治疗方式、个人耐受性等因素有关，医生通常会采取麻醉等措施减轻疼痛。
轻度牙周炎治疗时仅需基础洁治，可能仅有轻微酸胀感；中重度炎症伴牙槽骨吸收者，刮治或手术时可能出现短暂疼痛，但局部麻醉可有效控制。
超声波洁治和手工刮治会产生振动不适，但属于可耐受范围；牙周翻瓣术等手术治疗在麻醉下进行，术后可能有肿胀疼痛，通常3天内缓解。
对疼痛敏感者可通过术前沟通选择舒适化治疗，如笑气镇静或静脉麻醉；儿童及焦虑患者建议采用分散注意力等心理干预。
治疗后24小时内避免刷牙漱口，使用氯己定含漱液减少感染风险；进食温凉软食，按医嘱服用布洛芬等镇痛药物缓解不适。
治疗前后保持口腔清洁有助于减轻不适，定期复查可降低后续治疗难度。若出现持续剧烈疼痛或异常出血应及时复诊。
