部分水果的果皮可能含有毒素或难以消化，不建议连皮食用，主要有银杏果、柿子皮、荸荠皮、杨桃皮等。
银杏果皮含银杏酸和银杏酚等有毒成分，直接食用可能引发恶心呕吐，需彻底去除褐色外皮及内层软膜后食用果仁。
柿子皮富含鞣酸，与胃酸结合易形成胃结石，尤其未完全脱涩的柿子皮风险更高，建议削皮后食用果肉。
荸荠生长于淤泥中，表皮可能吸附寄生虫卵和重金属，生食带皮荸荠可能导致寄生虫感染，应去皮煮熟后食用。
杨桃皮含草酸盐结晶，肾功能不全者食用可能加重肾脏负担，健康人群也建议削皮以减少草酸摄入。
食用前充分清洗水果表面，对不确定安全性的果皮尽量去除，肠胃敏感者可选择苹果、梨等可去皮水果以降低刺激风险。
