先天性肠闭锁手术通常可以治愈，治疗效果与闭锁类型、手术时机及术后护理密切相关。主要影响因素有闭锁部位、并发症情况、手术方式选择、营养支持方案。
高位肠闭锁术后恢复较快，低位闭锁可能需多次手术修复。手术需重建肠道连续性，术后可能出现吻合口瘘。
合并肠穿孔或胎粪性腹膜炎时需紧急手术，并发症会延长恢复时间。术后需密切监测感染指标。
单纯闭锁可采用肠吻合术，复杂病例需肠造瘘分期手术。微创手术适用于部分新生儿病例。
术后需肠外营养过渡，逐步转为肠内喂养。早产儿需特别注意喂养耐受性。
术后应定期随访评估生长发育情况，按医嘱进行喂养调整，必要时补充维生素及微量元素。
