药物治疗新生儿泪囊炎可能出现轻微副作用，常见反应包括局部刺激、过敏反应、胃肠道不适及耐药性。药物需严格遵医嘱使用，多数症状可随治疗结束缓解。
部分眼用抗生素如妥布霉素滴眼液可能引起结膜充血或灼烧感，症状较轻时可继续观察，严重需复诊调整用药。
红霉素眼膏等药物可能导致眼睑红肿或皮疹，家长需立即停药并清洁眼部，配合医生更换抗过敏药物如色甘酸钠滴眼液。
口服抗生素如阿莫西林克拉维酸钾可能引发腹泻，建议家长在喂药后监测排便情况，必要时补充益生菌调节肠道菌群。
长期使用左氧氟沙星滴眼液可能导致细菌耐药，须严格按疗程用药，避免自行延长治疗时间。
家长需每日观察患儿用药反应，用药期间避免揉眼，若出现持续流泪加重或发热等症状应及时就医复查。
