病毒性腹泻与细菌性腹泻的区别主要体现在病原体类型、症状特点、传播途径及治疗方式上，常见病原体包括轮状病毒、诺如病毒与大肠杆菌、沙门氏菌等。
病毒性腹泻多由轮状病毒、诺如病毒引起；细菌性腹泻常见致病菌为大肠杆菌、沙门氏菌或志贺菌。
病毒性腹泻以水样便为主，伴低热和呕吐；细菌性腹泻多见黏液脓血便，高热和腹痛更显著。
病毒通过气溶胶或接触传播；细菌多经污染食物或水源传播，夏季高发。
病毒性腹泻以补液为主，可口服蒙脱石散、消旋卡多曲；细菌性腹泻需抗生素如阿奇霉素、头孢克肟，并配合益生菌调节。
两类腹泻均需注意预防脱水，婴幼儿及免疫低下者出现持续发热或血便应及时就医。
