中度睡眠呼吸暂停综合征通常需要综合治疗，药物治疗可作为辅助手段，但需在医生指导下使用。常用药物有乙酰唑胺、莫达非尼、氟替卡松鼻喷雾剂等。
乙酰唑胺可通过调节酸碱平衡减轻夜间呼吸紊乱，莫达非尼能改善日间嗜睡症状，氟替卡松鼻喷雾剂适用于合并过敏性鼻炎的患者。
持续气道正压通气是首选疗法，通过机械通气保持气道开放，治疗效果优于单纯药物干预。
减重、侧卧睡眠、戒烟限酒等行为干预能有效减轻症状，是基础治疗的重要组成部分。
对于解剖结构异常患者，需评估悬雍垂腭咽成形术或颌面外科手术的可行性。
建议睡眠监测确诊后制定个体化方案，药物治疗期间定期复查疗效和不良反应，配合呼吸机使用效果更佳。
