中医治疗百日咳可缓解痉挛性咳嗽、减少并发症，主要采用辨证施治结合外治法，常用方法有中药汤剂、穴位贴敷、推拿按摩、针灸疗法。
风邪犯肺证常用止嗽散加减，痰热壅肺证选用桑白皮汤，恢复期用沙参麦冬汤。常用中药包括杏仁、百部、桑白皮等，需根据证型调整配伍。
选取天突、膻中、肺俞等穴位，用白芥子、细辛等药物研末调敷，通过皮肤渗透作用缓解支气管痉挛，减轻阵发性呛咳症状。
清肺经、运八卦手法可宣肺止咳，配合揉掌小横纹、推膻中等手法，尤其适用于儿童患者，能改善气道高反应状态。
针刺列缺、尺泽等穴位配合艾灸大椎穴，对病程超过两周的迁延期患者效果显著，可调节免疫功能和神经反射。
治疗期间需保持空气湿润，避免冷空气和刺激性气味，饮食宜清淡易消化，严重痉挛发作时应及时配合西医解痉治疗。
