长期肺不张可能导致肺部感染、呼吸功能下降、肺组织纤维化或慢性呼吸衰竭，严重时可能引发肺动脉高压或肺心病。
肺不张区域易滞留分泌物，滋生细菌导致反复肺炎，需定期拍背排痰，必要时使用抗生素如阿莫西林、头孢呋辛、左氧氟沙星。
肺泡塌陷减少气体交换面积，表现为活动后气促，可通过呼吸训练改善，严重者需氧疗或使用支气管扩张剂如沙丁胺醇、异丙托溴铵、茶碱。
长期缺氧刺激成纤维细胞增生，胸部CT可见条索影，可尝试肺康复治疗，必要时使用抗纤维化药物如吡非尼酮、尼达尼布。
肺血管阻力持续增加导致右心负荷加重，晚期出现下肢水肿，需定期心超监测，药物可选波生坦、安立生坦、西地那非。
建议定期复查胸部影像学，进行呼吸功能锻炼，避免吸烟及呼吸道刺激物，出现持续咳嗽、发热或呼吸困难应及时就诊。
