脊髓空洞症患者的生存期差异较大，轻症患者可能长期稳定存活，重症合并延髓受累者预后较差。生存期主要受空洞位置、进展速度、是否合并Chiari畸形、神经损伤程度、治疗时机等因素影响。
脊髓空洞症是一种慢性进展性疾病，其预后与空洞所在脊髓节段密切相关。颈段空洞早期可能仅表现为手部肌肉萎缩和痛温觉分离，患者通过规范治疗和康复训练可维持数十年相对正常生活。部分患者空洞进展缓慢，终身未出现严重功能障碍，自然寿命接近常人。定期进行磁共振检查监测空洞变化，配合神经营养药物和物理治疗，有助于延缓病情恶化。
当空洞向上扩展至延髓或合并Chiari畸形时，可能引发吞咽困难、呼吸功能障碍等危及生命的并发症。这类患者若未及时接受减压手术，可能在数年内因呼吸衰竭或肺部感染导致死亡。术后患者仍需长期随访，约三成病例可能出现空洞复发或症状加重。合并严重脊柱侧弯者可能因胸廓畸形影响心肺功能，进一步缩短预期寿命。
脊髓空洞症患者应避免颈部剧烈活动，定期进行肺功能和吞咽评估，预防跌倒等意外伤害。饮食需保证充足蛋白质和维生素B族摄入，适度进行水中运动或康复训练以维持肌肉功能。出现呼吸困难、反复呛咳等症状需立即就医，早期干预可显著改善生存质量。
