慢性附睾炎多数情况下可以治愈，但存在复发可能。治疗效果与病程长短、治疗规范性、个体免疫状态密切相关。
急性期需足疗程使用抗生素如左氧氟沙星、头孢曲松、多西环素，配合非甾体抗炎药缓解疼痛，慢性期可结合物理治疗促进炎症吸收。
需纠正久坐、憋尿等不良习惯，处理泌尿系统感染灶，合并前列腺炎或精囊炎时需同步治疗，避免病原体持续逆行感染。
反复发作者可检测免疫功能，必要时使用脾氨肽口服冻干粉等免疫调节剂，中医辨证施治采用活血化瘀类药物改善局部微循环。
对合并脓肿、窦道或顽固性疼痛患者，可考虑附睾切除术或输精管结扎术，术后需配合抗感染治疗防止并发症。
保持会阴清洁干燥，避免辛辣刺激饮食，适度运动增强抵抗力，定期复查至症状完全消失3个月以上。
