真菌感染可能导致口腔糜烂，常见疾病包括轻度口腔念珠菌病、侵袭性真菌性口炎、继发性真菌感染及罕见毛霉菌病，症状按早期白膜形成、进展期黏膜充血糜烂、终末期深部组织坏死发展。
白色念珠菌过度繁殖引起，表现为颊黏膜或舌背白色伪膜，刮除后显露充血基底，可使用制霉菌素混悬液、克霉唑含片或氟康唑胶囊治疗。
长期使用抗生素或免疫抑制导致，黏膜广泛充血糜烂伴灼痛，需停用诱发药物并采用两性霉素B含漱、伊曲康唑口服联合碳酸氢钠溶液漱口。
糖尿病或HIV感染者易继发组织坏死，可见灰黑色坏死灶伴恶臭，需控制基础疾病同时使用伏立康唑注射剂或卡泊芬净静脉给药。
罕见但凶险的接合菌感染，表现为快速进展的黏膜缺血性溃疡，需手术清创配合两性霉素B脂质体及泊沙康唑抢救治疗。
日常保持口腔清洁，避免含糖食物残留，佩戴义齿者需每日消毒，出现黏膜白斑或溃疡超过两周未愈应及时就诊口腔黏膜科。
