病毒性食管炎可能由单纯疱疹病毒、巨细胞病毒、水痘-带状疱疹病毒感染引起，通常表现为吞咽疼痛、胸骨后灼热感、食欲下降等症状，可通过抗病毒药物、黏膜保护剂、营养支持等方式治疗。
单纯疱疹病毒1型是最常见病原体，免疫低下者易感，伴随口腔疱疹或发热，治疗需使用阿昔洛韦、更昔洛韦等抗病毒药物，配合硫糖铝混悬液保护黏膜。
艾滋病或器官移植后使用免疫抑制剂会导致防御功能下降，可能引发巨细胞病毒性食管炎，出现呕血或黑便，需静脉注射缬更昔洛韦并纠正营养不良。
胃食管反流或化学刺激造成黏膜屏障破坏，增加病毒易感性，表现为进食后胸痛加重，治疗需联合奥美拉唑抑制胃酸，并补充维生素B族促进修复。
水痘-带状疱疹病毒或EB病毒偶可引起食管溃疡，伴随皮肤疱疹或淋巴结肿大，需采用泛昔洛韦抗病毒，严重时需内镜下止血或支架置入。
急性期选择流质饮食避免刺激，恢复期增加优质蛋白摄入，定期复查胃镜评估愈合情况，免疫功能异常者需长期预防性抗病毒治疗。
