金匮肾气丸的副作用主要包括口干舌燥、胃肠不适、过敏反应及电解质紊乱，通常与个体差异或用药不当有关。
金匮肾气丸中的附子等温阳成分可能加速体内水分消耗，表现为口渴、咽干。轻度症状可通过增加饮水缓解，严重者需调整用药方案。
部分患者服药后出现腹胀、腹泻，与方中熟地黄滋腻碍胃有关。建议饭后服用，必要时联用香砂养胃丸等护胃药物。
体质敏感者可能对桂枝、牡丹皮等成分过敏，引发皮肤瘙痒或红疹。需立即停药并口服氯雷他定片，外用炉甘石洗剂缓解症状。
长期过量服用可能导致低钾血症，与泽泻的利尿作用相关。用药期间应定期监测血钾，必要时补充门冬氨酸钾镁片。
服用金匮肾气丸期间避免辛辣刺激饮食，出现持续不适应及时就医评估。阴虚火旺或实热证患者禁用该药。
