支原体肺炎存在复发可能，复发风险与免疫力低下、治疗不彻底、重复感染、基础疾病等因素有关。
免疫功能较弱者易复发，表现为咳嗽反复或低热不退。建议加强营养摄入，保证充足睡眠，必要时可遵医嘱使用匹多莫德、脾氨肽等免疫调节剂。
未完成足疗程抗生素治疗可能导致病原体残留。需规范使用阿奇霉素、多西环素或左氧氟沙星等药物，并复查胸片确认病灶吸收。
接触新传染源会再次发病，常伴咽痛和乏力。避免前往人群密集场所，接触患者时佩戴口罩，复发时可使用克拉霉素或莫西沙星治疗。
合并慢阻肺或哮喘者复发概率高，多伴有气促。需控制原发病，急性期联用甲泼尼龙缓解气道炎症，长期使用布地奈德吸入剂维持。
康复期应保持室内通风，每日进行呼吸操锻炼，适量补充维生素A和锌元素以促进呼吸道黏膜修复。
