小茴香可能引起胃肠道不适、过敏反应、低血糖及药物相互作用等副作用，通常与过量摄入或特殊体质有关。
过量食用小茴香可能刺激胃肠黏膜，导致腹胀、恶心或腹泻。建议控制每日摄入量，出现症状时可暂停食用并观察。
部分人群对小茴香中的挥发油成分过敏，表现为皮肤瘙痒、皮疹或呼吸道症状。过敏体质者初次食用需谨慎测试。
小茴香可能增强降糖药效果，糖尿病患者联合使用时需监测血糖，避免出现头晕、冷汗等低血糖症状。
小茴香与抗凝血药、镇静剂可能存在相互作用，长期服药者应咨询医生后再食用。
日常使用小茴香建议控制剂量，烹饪时少量添加，特殊人群食用前可咨询专业医师意见。
