新生儿低位肛闭需通过肛门成形术治疗，手术方法主要有肛门皮瓣转移术、肛门扩张术、会阴肛门成形术、骶尾入路肛门成形术。
适用于肛门狭窄较轻的患儿，通过局部皮瓣转移重建肛门口径，术后须定期扩肛防止瘢痕挛缩。
针对单纯性膜状闭锁，采用十字切开闭锁膜后持续扩张，需配合使用红霉素软膏预防感染。
适用于直肠末端距皮肤较近者，术中需重建肛管直肠角，术后可能出现肛门失禁等并发症。
用于直肠盲端位置较高的情况，需术中电生理监测保护盆底神经，术后需进行排便功能训练。
建议术后喂养母乳或深度水解配方奶，保持会阴清洁干燥，按医嘱进行肛门按摩和功能锻炼。
