马尾连具有清热解毒、燥湿止痢、凉血止血等功效，主要用于治疗痢疾、肠炎、吐血、衄血等病症。
马尾连性寒味苦，能清除体内热毒，适用于热毒炽盛引起的咽喉肿痛、口舌生疮等症状，可配伍金银花、连翘等药物使用。
对湿热下注导致的腹泻、痢疾有显著疗效，常与黄连、黄柏同用，能缓解里急后重、大便脓血等肠道湿热症状。
可治疗血热妄行引起的鼻出血、牙龈出血及皮下瘀斑，多配合生地、丹皮等凉血药物协同增效。
含小檗碱等成分对痢疾杆菌、金黄色葡萄球菌有抑制作用，适用于细菌性肠道感染和皮肤化脓性炎症。
使用马尾连需遵医嘱，脾胃虚寒者慎用，服药期间忌食辛辣刺激食物，出现过敏反应应立即停用。
