益菌因子有助于维持肠道菌群平衡、增强免疫力、促进营养吸收、改善消化功能。益生菌补充剂在特定情况下可辅助治疗肠道菌群失调相关疾病。
益菌因子作为益生元可选择性促进双歧杆菌等有益菌增殖，抑制致病菌生长，改善肠道微生态环境。乳果糖、低聚果糖等益生元制剂常用于功能性便秘的辅助治疗。
肠道菌群通过刺激派尔集合淋巴结促进免疫球蛋白A分泌，增强黏膜免疫屏障功能。临床常用双歧杆菌三联活菌胶囊调节抗生素相关性腹泻患者的免疫功能。
短链脂肪酸等菌群代谢产物可改善肠上皮细胞营养状态，提高钙镁铁等矿物质吸收率。酪酸梭菌活菌散常用于炎症性肠病患者的营养支持治疗。
益生菌分泌的消化酶可分解乳糖和膳食纤维，缓解腹胀腹泻症状。枯草杆菌二联活菌颗粒常用于婴幼儿消化不良的辅助治疗。
日常可通过酸奶、泡菜等发酵食品补充益生菌，使用益生菌制剂需在医生指导下进行，避免与抗生素同服影响疗效。
